MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN02

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013862	GGT	2	6	1181	1186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013862	TGA	2	6	1206	1211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013862	ACA	2	6	1294	1299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013862	AGTC	2	8	2006	2013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013862	GTC	2	6	9819	9824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013862	GCG	2	6	9884	9889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013862	CGA	2	6	9907	9912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013862	GT	4	8	9947	9954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013862	T	6	6	10022	10027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013862	GATA	2	8	10030	10037	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013862	TCT	2	6	10042	10047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013862	AAC	2	6	10072	10077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013862	AAAG	2	8	10136	10143	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013862	GAA	2	6	10153	10158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013862	AGAA	2	8	10163	10170	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013862	A	8	8	10181	10188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013862	A	6	6	10199	10204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013862	TGA	2	6	10259	10264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013862	GATA	2	8	10275	10282	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013862	A	6	6	10303	10308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013862	A	6	6	10316	10321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013862	A	7	7	10324	10330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013862	AAG	2	6	10384	10389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013862	GAT	2	6	10438	10443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013862	ATC	2	6	10454	10459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013862	CT	3	6	10470	10475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013862	AGC	2	6	10496	10501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013862	ACT	2	6	10504	10509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013862	T	7	7	10526	10532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013862	AGATC	2	10	10537	10546	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013862	T	6	6	10554	10559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013862	GATCT	2	10	10577	10586	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_013862	CCG	2	6	10977	10982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_013862	ACA	2	6	11016	11021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013862	CGC	2	6	11041	11046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_013862	GGC	2	6	11078	11083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013862	CGA	2	6	11086	11091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013862	TGAA	2	8	11658	11665	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013862	CGTG	2	8	11671	11678	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013862	GAT	2	6	11682	11687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013862	A	6	6	13567	13572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013862	TC	3	6	13600	13605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013862	AGTT	2	8	13614	13621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013862	CAA	2	6	13638	13643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013862	GCA	2	6	13682	13687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013862	CGT	2	6	13794	13799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013862	CCT	2	6	13835	13840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_013862	GTC	2	6	15151	15156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013862	T	6	6	15185	15190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013862	GTT	2	6	16335	16340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013862	T	7	7	16416	16422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013862	AGTC	2	8	16514	16521	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013862	GGAT	2	8	16599	16606	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013862	TGTA	2	8	16687	16694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013862	TG	3	6	16704	16709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013862	CTA	2	6	16762	16767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013862	GC	3	6	16784	16789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013862	CT	4	8	16811	16818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013862	GAT	2	6	16827	16832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013862	ATGT	2	8	16889	16896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013862	ATGA	2	8	16960	16967	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013862	TGT	2	6	16983	16988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013862	TA	3	6	17002	17007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013862	TCC	2	6	17074	17079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_013862	GAC	2	6	17104	17109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013862	A	6	6	17114	17119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013862	C	7	7	17157	17163	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68	NC_013862	AT	3	6	17220	17225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013862	GAG	2	6	17233	17238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013862	TGTTCA	2	12	17726	17737	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013862	GGA	2	6	17748	17753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013862	CA	3	6	18028	18033	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013862	CT	3	6	18981	18986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013862	CT	3	6	19007	19012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013862	GTCA	2	8	19026	19033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013862	T	6	6	19051	19056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013862	C	6	6	20080	20085	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NC_013862	GCG	2	6	21468	21473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013862	CGC	2	6	21481	21486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_013862	CGT	3	9	21501	21509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013862	CGTT	2	8	22521	22528	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013862	T	7	7	22570	22576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013862	CATC	2	8	24410	24417	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013862	CTTTTT	2	12	25060	25071	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_013862	TGT	2	6	25112	25117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013862	GAA	2	6	25183	25188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013862	A	7	7	25236	25242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013862	AAGA	2	8	25357	25364	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013862	AGT	2	6	25367	25372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013862	AAT	2	6	25385	25390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013862	AAAG	2	8	25405	25412	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013862	T	6	6	25479	25484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013862	GT	3	6	25518	25523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013862	GAC	2	6	25554	25559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013862	GAT	2	6	25560	25565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013862	TAAC	2	8	29669	29676	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013862	TAA	2	6	30784	30789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013862	TAGC	2	8	30800	30807	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013862	CGC	2	6	30832	30837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_013862	ATC	2	6	30847	30852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013862	T	7	7	30853	30859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013862	AGC	2	6	30982	30987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013862	GC	3	6	31223	31228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013862	ATT	2	6	31264	31269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013862	TGG	2	6	31295	31300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013862	CAC	2	6	31314	31319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_013862	CAA	2	6	31342	31347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013862	GTA	2	6	31353	31358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013862	TTA	2	6	31968	31973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013862	CAA	2	6	31977	31982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013862	TCG	2	6	32129	32134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013862	CCA	2	6	32154	32159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_013862	GTT	2	6	32425	32430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013862	AAT	2	6	32435	32440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013862	CGA	2	6	32586	32591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013862	ACCG	2	8	33428	33435	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013862	GTTT	2	8	33469	33476	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013862	TTTG	2	8	33498	33505	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013862	CTG	2	6	34361	34366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013862	GA	3	6	34412	34417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013862	ACA	2	6	35230	35235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013862	TAT	3	9	36427	36435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013862	ATT	2	6	36439	36444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013862	AT	3	6	36834	36839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013862	GTTT	2	8	36841	36848	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013862	TGAT	2	8	36853	36860	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013862	CTGC	2	8	37483	37490	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013862	AGC	2	6	37623	37628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013862	GA	3	6	37693	37698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013862	GGA	2	6	37737	37742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013862	CCA	2	6	37756	37761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_013862	GT	3	6	37848	37853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013862	CAT	2	6	37978	37983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013862	CCT	2	6	38420	38425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_013862	TGG	2	6	38751	38756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013862	GGTT	2	8	38797	38804	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013862	GA	3	6	38953	38958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013862	GA	3	6	38997	39002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013862	TAT	2	6	39010	39015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.